John Milne fue profesor de minería y geología en el Colegio de Ingeniería de
Tokio desde el 8 de marzo de 1876 al 20 de junio de 1895. Cuando estaba en el Colegio de Ingeniería trabajó bajo la dirección de
Henry Dyer y junto a
William Edward Ayrton y
John Perry. En 1880, todos los científicos británicos trabajando en Japón estudiaron los terremotos. Fundaron la Sociedad Sismológica de Japón y financió la invención de los sismógrafos para detectar los terremotos. A John Milne se le acredita la invención del sismógrafo de péndulo horizontal en 1880.
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